2007年，中等专业学校3所，在校生0.46万人。普通高中3所，在校生1.00万人。普通初中31所，在校生3.97万人。小学158所，在校生5.07万人。特殊教育学校1所，在校生0.01万人。
2012年，微山县普通高中3所，招生3524人，在校学生10446人。初级中学27所，招生6072人，在校学生18539人。小学141所（含26处教学点），招生7283人，在校学生40774人。学龄儿童入学率达100%，小学毕业生升学率99.8%，初中毕业生升学率82%。微山县公办幼儿园91所，在园幼儿数13714人。微山县1所特殊教育学校，在校生125人。微山县普通中学专任教师2652人，其中，普通初中教师1861人，高中教师791人。中学体育运动场面积42.5万平方米；计算机5725台，图书藏书量118.08万册。小学体育运动场面积45.91万平方米，计算机5457台，图书藏书量88.67万册。